Najwyższa Izba Kontroli negatywnie ocenia realizację przez 36 SPLT w latach 2005-2010 zadań w zakresie objętym kontrolą. Ocenę negatywną uzasadnia w szczególności podejmowanie w wielu przypadkach niezgodnych z obowiązującymi przepisami działań dotyczących organizacji lotów oraz zapewnienia bezpieczeństwa osobom zajmującym kierownicze stanowiska w państwie w trakcie realizacji lotów.

Najwyższa Izba Kontroli ocenia, iż Minister Obrony Narodowej nierzetelnie wywiązywał się z obowiązku kierowania i nadzoru nad realizacją przez Siły Zbrojne RP zadań w zakresie organizacji lotów i zapewnienia bezpieczeństwa osobom zajmującym kierownicze stanowiska w państwie w latach 2005-2010.

Najwyższa Izba Kontroli ocenia, iż Dowódca Sił Powietrznych nierzetelnie wywiązywał się z nałożonych na niego zadań w zakresie organizacji lotów i zapewnienia bezpieczeństwa osobom zajmującym kierownicze stanowiska w państwie w latach 2005-2010. Negatywna ocena kontrolowanej działalności znajduje uzasadnienie m.in. w braku skutecznego nadzoru nad działalnością 36 splt, zbyt późnym reagowaniu na negatywne zjawiska oraz zmiany zachodzące w pułku, niewystarczającym monitorowaniu realizacji wniosków wypływających z analiz stanu bezpieczeństwa i kontroli jednostek lotniczych.